DSA Faculty
API
← к списку преподавателей

Князев Евгений Николаевич

Факультет биологии и биотехнологии

Профиль на hse.ru ↗ тел.: 15093
Публикаций
0
Языков
1
Наград
7
Конференций
9
Профиль Публикации (33) Курсы (11)

Профессиональные интересы

биохимияонкологиямодель кишечника человека in vitroбиоинформатикаперсонифицированная медицинабиология ракаклеточная биологиятрехмерные клеточные моделимикрофлюидикамикрофизиологические системымолекулярная биологияплацентарный барьер

Должности

  • Доцент — Факультет биологии и биотехнологии, Базовая кафедра Института биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН
  • Заведующий лабораторией — Факультет биологии и биотехнологии, Лаборатория молекулярной физиологии

Био

  • · Начал работать в НИУ ВШЭ в 2019 году.
  • · Научно-педагогический стаж: 14 лет.

Образование

  • 2016 · Кандидат медицинских наук: специальность Онкология, тема диссертации: МикроРНК-маркеры для малоинвазивной диагностики рака предстательной железы
  • 2013 · Специалитет: Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, факультет: Факультет фундаментальной медицины, специальность «Лечебное дело», квалификация «Врач»

Опыт работы

  • · 2019 — по настоящее время: Декабрь : факультет биологии и биотехнологии, Национальный исследовательский университет «Высшая школа экономики», доцент, заведующий лабораторией молекулярной физиологии
  • · 2019 — по настоящее время: Май : лаборатория микрофлюидных технологий для биомедицины, ФГБУН Государственный Научный Центр Российской Федерации Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, старший научный сотрудник
  • · 2013: Февраль сентябрь
  • · 2023: : ООО «Центр трансляционных технологий» (ООО Лаборатория «БиоКлиникум»), генеральный директор
  • · 2022: Ноябрь июнь
  • · 2023: : факультет Биомедицинская техника, Московский государственный технический университет им. Н.Э. Баумана, доцент
  • · 2021: Август февраль
  • · 2022: : Городская клиническая больница №15 им О.М. Филатова, врач клинической лабораторной диагностики
  • · 2019: Февраль август
  • · 2019: : Национальный медицинский исследовательский центр терапии и профилактической медицины Министерства здравоохранения Российской Федерации, старший научный сотрудник
  • · 2013: Сентябрь июнь
  • · 2015: : Государственный научный центр Российской Федерации — Институт медико-биологических проблем РАН, научный сотрудник
  • · 2012: Февраль январь
  • · 2013: : ООО НТЦ «Клеточные Технологии», лаборант-исследователь

Награды и поощрения

  • · Благодарность первого проректора НИУ ВШЭ (март 2023)
  • · Надбавка за академические успехи и вклад в научную репутацию НИУ ВШЭ (2024–2026)
  • · Надбавка за публикацию в журнале из Списка А (и приравненном к нему научном издании) (2025–2026, 2023–2024)
  • · Надбавка за публикацию в международном рецензируемом научном издании (2022–2023, 2021–2022)
  • · Лучший преподаватель — 2024
  • · Победитель Конкурса лучших русскоязычных научных и научно-популярных работ работников НИУ ВШЭ – 2023
  • · Группа высокого профессионального потенциала (кадровый резерв НИУ ВШЭ)Категория "Новые преподаватели" (2024–2025)

Гранты и проекты

  • — · на соискание учёной степени кандидата наук

Конференции (9)

Показать все
  • · 2024: Седьмой онлайн-семинар по математическому моделированию в области иммунологии (Москва). Доклад: Моделирование динамики SARS-CoV-2 в клеточных линиях
  • · 2024: Второй Саммит разработчиков лекарственных препаратов «Сириус.Биотех» (Федеральная территория «Сириус»). Доклад: Использование платформы «Человек-на-чипе» при разработке лекарственных препаратов
  • · 2024: IV Конгресс молодых учёных. Доклад: Использование платформы Homunculus для моделирования органов-на-чипе
  • · 2019: International Federation of Placenta Associations 2019 (IFPA2019); 8th Latin American Symposium on Maternal-Fetal Interaction and Placenta (VIII SLIMP), Buenos Aires, Argentina (Buenos Aires). Доклад: Placenta-on-a-chip model for assessing the transport and toxicity of xenobiotics in vitro
  • · 2019: International Federation of Placenta Associations 2019 (IFPA2019); 8th Latin American Symposium on Maternal-Fetal Interaction and Placenta (VIII SLIMP), Buenos Aires, Argentina (Buenos Aires). Доклад: Application of impedance spectroscopy for analysis of BeWo clone b30 human choriocarcinoma cell line
  • · 2019: CTR Annual Conference 2019 (Cambridge). Доклад: Placenta-on-a-chip model for the assessment of drug transport and toxicity
  • · 2019: 22st European Congress on Alternatives to Animal Testing, 19th Annual Congress of EUSAAT, Linz, Austria (Linz). Доклад: Placenta-on-a-chip model for assessing the transport and toxicity of xenobiotics in vitro
  • · 2019: Второй международный форум онкологии и радиологии (Москва). Доклад: Модель плаценты-на-чипе in vitro для оценки транспорта и токсичности химиотерапевтических препаратов
  • · 2019: V Всероссийская Конференция по молекулярной онкологии (Москва). Доклад: Модель плаценты-на-чипе in vitro для оценки транспорта и токсичности химиотерапевтических препаратов

Идентификаторы исследователя

Публикации (33)

Ингибитор деметилаз семейства KDM5 — KDOAM-25 — снижает проникновение псевдотипированных вирусных частиц SARS-CoV-2 в клетки

2023 · ARTICLE · ru

Изучено влияние ингибиторов деметилаз семейства KDM5 (JIB-04, PBIT и KDOAM-25) на проникновение псевдотипированных вирусных частиц SARS-CoV-2 в дифференцированные клетки Caco-2 и клетки HEK293T с гиперэкспрессией ACE2. Указанные препараты не были цитотоксичными. Только KDOAM-25 значимо снижал проникновение вирусных частиц в клетки. При этом уровень экспрессии мРНК ACE2 в Caco-2 значимо повышался, а экспрессия TMPRSS2 значимо не изменялась. KDOAM-25 в дифференцированных клетках Caco-2 не влиял на экспрессию генов BRCA1, CDH1, TP53, SNAI1, VIM и UGCG, для которых ранее была показана связь с нокдауном или гиперэкспрессией деметилаз KDM5 или действием ингибиторов деметилаз, однако в недифференцированных клетках Caco-2 под действием KDOAM-25 значимо повышалась экспрессия BRCA1, SNAI1, VIM и CDH1.

DOI ↗ PDF ↗

KDM5 Family Demethylase Inhibitor KDOAM-25 Reduces Entry of SARS-CoV-2 Pseudotyped Viral Particles into Cells

2023 · ARTICLE · en

We studied the effect of KDM5 family demethylase inhibitors (JIB-04, PBIT, and KDOAM-25) on the penetration of SARS-CoV-2 pseudotyped viruses into differentiated Caco-2 cells and HEK293T cells with ACE2 hyperexpression. The above drugs were not cytotoxic. Only KDOAM-25 significantly reduced virus entry into the cells. The expression of ACE2 mRNA in Caco-2 significantly increased, while TMPRSS2 expression did not significantly change under these conditions. In differentiated Caco-2 cells, KDOAM-25 did not affect the expression of BRCA1, CDH1, TP53, SNAI1, VIM, and UGCG genes, for which an association with knockdown or overexpression of KDM5 demethylases or with the action of demethylase inhibitors had previously been shown. In undifferentiated Caco-2 cells, the expression of BRCA1, SNAI1, VIM, and CDH1 was significantly increased under the action of KDOAM-25.

DOI ↗ PDF ↗

Профессиональная учебная практика: I курс : Учебно-методическое пособие для студентов и преподавателей - 2-е изд., испр.

2023 · BOOK · ru

В пособии кратко изложены теоретические и практические аспекты первичных навыков, необходимых для работы в биологической лаборатории, а также приведены протоколы практических занятий в рамках профессиональной учебной практики (ознакомительной) I курса бакалаврской программы «Клеточная и молекулярная биотехнология» факультета биологии и биотехнологии НИУ ВШЭ. Учебно-методическое пособие предназначено для студентов и преподавателей факультета биологии и биотехнологии НИУ ВШЭ и всех заинтересованных лиц.

DOI ↗ PDF ↗

Chemical Induction of Trophoblast Hypoxia by Cobalt Chloride Leads to Increased Expression of DDIT3

2021 · ARTICLE · en

Choriocarcinoma cells BeWo b30 are used to model human placental trophoblast hypoxia using cobalt (II) chloride and hydroxyquinoline derivative (HD) as chemical inducers of hypoxia-inducible factor (HIF). In this study, it was shown that both substances activate the hypoxic pathway and the epithelial–mesenchymal transition and inhibit the pathways of cell proliferation. However, CoCl2 caused activation of the apoptosis pathway, increased the activity of effector caspases 3 and 7, and increased the expression of the unfolded protein response target DDIT3. The mTORC1 pathway was activated upon exposition to CoCl2, while HD suppressed this pathway, as it happens during real trophoblast hypoxia. Thus, effect of CoCl2 on BeWo cells can be a model of severe hypoxia with activation of apoptosis, while HD mimics moderate hypoxia.

DOI ↗ PDF ↗

Endocytosis and Transcytosis of SARS-CoV-2 Across the Intestinal Epithelium and Other Tissue Barriers

2021 · ARTICLE · en

Since 2003, the world has been confronted with three new betacoronaviruses that cause human respiratory infections: SARS-CoV, which causes severe acute respiratory syndrome (SARS), MERS-CoV, which causes Middle East respiratory syndrome (MERS), and SARS-CoV-2, which causes Coronavirus Disease 2019 (COVID-19). The mechanisms of coronavirus transmission and dissemination in the human body determine the diagnostic and therapeutic strategies. An important problem is the possibility that viral particles overcome tissue barriers such as the intestine, respiratory tract, blood-brain barrier, and placenta. In this work, we will 1) consider the issue of endocytosis and the possibility of transcytosis and paracellular trafficking of coronaviruses across tissue barriers with an emphasis on the intestinal epithelium; 2) discuss the possibility of antibody-mediated transcytosis of opsonized viruses due to complexes of immunoglobulins with their receptors; 3) assess the possibility of the virus transfer into extracellular vesicles during intracellular transport; and 4) describe the clinical significance of these processes. Models of the intestinal epithelium and other barrier tissues for in vitro transcytosis studies will also be briefly characterized.

DOI ↗ PDF ↗

HIF-Dependent NFATC1 Activation Upregulates ITGA5 and PLAUR in Intestinal Epithelium in Inflammatory Bowel Disease

2021 · ARTICLE · en

Intestinal epithelial cells exist in physiological hypoxia, leading to hypoxia-inducible factor (HIF) activation and supporting barrier function and cell metabolism of the intestinal epithelium. In contrast, pathological hypoxia is a common feature of some chronic disorders, including inflammatory bowel disease (IBD). This work was aimed at studying HIF-associated changes in the intestinal epithelium in IBD. In the first step, a list of genes responding to chemical activation of hypoxia was obtained in an in vitro intestinal cell model with RNA sequencing. Cobalt (II) chloride and oxyquinoline treatment of both undifferentiated and differentiated Caco-2 cells activate the HIF-signaling pathway according to gene set enrichment analysis. The core gene set responding to chemical hypoxia stimulation in the intestinal model included 115 upregulated and 69 downregulated genes. Of this set, protein product was detected for 32 genes, and fold changes in proteome and RNA sequencing significantly correlate. Analysis of publicly available RNA sequencing set of the intestinal epithelial cells of patients with IBD confirmed HIF-1 signaling pathway activation in sigmoid colon of patients with ulcerative colitis and terminal ileum of patients with Crohn’s disease. Of the core gene set from the gut hypoxia model, expression activation of ITGA5 and PLAUR genes encoding integrin α5 and urokinase-type plasminogen activator receptor (uPAR) was detected in IBD specimens. The interaction of these molecules can activate cell migration and regenerative processes in the epithelium. Transcription factor analysis with the previously developed miRGTF tool revealed the possible role of HIF1A and NFATC1 in the regulation of ITGA5 and PLAUR gene expression. Detected genes can serve as markers of IBD progression and intestinal hypoxia.

DOI ↗ PDF ↗

Knockdown of the α5 Laminin Chain Affects Differentiation of Colorectal Cancer Cells and Their Sensitivity to Chemotherapy

2020 · ARTICLE · en

The interaction of tumor cells with the extracellular matrix (ECM) may affect the rate of cancer progression and metastasis. One of the major components of ECM are laminins, the heterotrimeric glycoproteins consisting of α-, β-, and γ-chains (αβγ). Laminins interact with their cell surface receptors and, thus, regulate multiple cellular processes. In this work, we demonstrate that shRNA-mediated knockdown of the α5 laminin chain results in Wnt- and mTORC1-dependent partial dedifferentiation of colorectal cancer cells. Furthermore, we showed that this dedifferentiation involved activation of ER-stress signaling, pathway promoting the sensitivity of cells to 5-fluorouracil.

DOI ↗ PDF ↗

Integrative analysis of miRNA and mRNA sequencing data reveals potential regulatory mechanisms of ACE2 and TMPRSS2

2020 · ARTICLE · en

Development of novel approaches for regulating the expression of angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) and transmembrane serine protease 2 (TMPRSS2) is becoming increasingly important within the context of the ongoing COVID-19 pandemic since these enzymes play a crucial role in cell infection. In this work we searched for putative ACE2 and TMPRSS2 expression regulation networks mediated by various miRNA isoforms (isomiR) across different human organs using publicly available paired miRNA/mRNA-sequencing data from The Cancer Genome Atlas (TCGA) project. As a result, we identified several miRNA families targeting ACE2 and TMPRSS2 genes in multiple tissues. In particular, we found that lysine-specific demethylase 5B (JARID1B), encoded by the KDM5B gene, can indirectly affect ACE2 / TMPRSS2 expression by repressing transcription of hsa-let-7e / hsa-mir-125a and hsa-mir-141 / hsa-miR-200 miRNA families which are targeting these genes.

DOI ↗ PDF ↗

Differences in the Drosha and Dicer Cleavage Profiles in Colorectal Cancer and Normal Colon Tissue Samples

2020 · ARTICLE · en

Human colorectal adenocarcinoma cell line Caco-2 is often used as a model of healthy intestinal epithelium, in particular, in miRNA studies. The work of the enzymes Drosha and Dicer is an integral part of the process of miRNA formation. Inaccuracies in the work of these enzymes lead to a change in the nucleotide sequences of miRNAs with the formation of new isoforms, which, in turn, can change intracellular regulatory mechanisms. In the framework of this study, it was shown that the quantitative estimates of inaccuracies in Drosha and Dicer activity significantly differ between the specimens of normal colon tissue and malignant colorectal tumors.

DOI ↗ PDF ↗

Factors Involved in miRNA Processing Change Its Expression Level during Imitation of Hypoxia in BeWo b30 Cells

2020 · ARTICLE · en

One of the main complications of pregnancy and causes of maternal and perinatal mortality is preeclampsia. The pathophysiology of preeclampsia is associated with the development of placenta and fetal hypoxia and secretion of a number of effective molecules. The human choriocarcinoma cell line BeWo b30 is often used as a model of the placental barrier. It was shown that oxyquinoline derivatives can mimic hypoxia by suppressing HIF-prolyl hydroxylases and the accumulation of HIF-1α. This effect also leads to a change in the expression of microRNAs and their target genes. However, with hypoxia in cells, not only the level of individual miRNAs but also the ratio of miRNA isoforms (isomiRs) can change, presumably due to inaccuracies in the work of the Drosha and Dicer enzymes. In this work, we showed a change in the expression of the factors involved in the maturation of miRNAs when simulating hypoxia in BeWo b30 cells with an oxyquinoline derivative, which may be one of the causes for the change in the ratio of miRNA isoforms.

DOI ↗ PDF ↗

Курсы (11)