Публикации
Правовой режим биобанков и биоматериалов: актуальные проблемы и правовые методы их решения
0.6562019 · ARTICLE · ru
Деятельность биобанков приобретает все большее значение для современной медицины и выводит научные исследования на принципиально новый уровень. Во многом это связано с получением возможности расшифровки генома и обработки информации о здоровье донора, извлекаемой из биоматериалов. В последние годы наблюдаются общемировые тенденции по развитию деятельности биобанков и их объединению в единые сети. Вместе с тем законодательство большинства стран не содержит чёткого определения правового положения биобанков, что ставит под удар права и интересы всех участников возникающих общественных отношений. В свете стремительного развития биобанков и возрастающего значения информации о доноре для научных исследований и медицины в целом, снова возникает вопрос о правовом режиме биоматериалов. Фрагментарное регулирование, а зачастую и вовсе его отсутствие, создает правовую неопределённость отношений в этой области, препятствуя дальнейшему развитию. В настоящей статье рассмотрены актуальные правовые проблемы в сфере биобанков, а также предложены возможные способы их решения с учетом опыта зарубежных стран.
ВЕРИФИЦИРУЕМОСТЬ ДАННЫХ В ИССЛЕДОВАНИИ
0.6392019 · ARTICLE · ru
Косычева М. А., Михаил Григорьевич Б.
Рассматривается принцип верифицируемое™ как основа построения научного исследования. Описываются возможности установления истинности научных утверждений в результате эмпирической проверки. Дается понятие публикационного искажения (publication bias). Приводятся примеры манипуляций с научными данными. Проанализировано создание научных репозиториев как средств длительного хранения, накопления и обеспечения открытого доступа к результатам научных исследований.
Технология «динамического молекулярного портрета» в вычислительном анализе белков и биомембран
0.6322019 · CHAPTER · ru
Детальный анализ меняющихся во времени свойств молекулярных поверхностей играет важную роль в процессах распознавания, взаимодействия и передачи сигналов в биомолекулярных системах. Технология «динамического молекулярного портрета» представляет собой современный подход к расчету, наглядной визуализации и сравнительному анализу различных физико-химических характеристик поверхности биомолекул. Эффективное использование таких подходов требует создания специальных методов компьютерной обработки, анализа и представления «молекулярных портретов». Описано применение технологии в работе с белками, мембранами и их комплексами. Показано, что в результате удается повысить точность решения задач молекулярного докинга белок-лиганд, белок-белок и белок-мембрана. Кроме того, предложен оригинальный метод «белковой топографии», который позволяет наглядно представить полную поверхность молекулы белка в виде двумерных карт. Он применяется также для выявления конформационных изменений между различными состояниями молекул, для проведения сравнительного анализа групп биообъектов, нахождения в них общих и специфических характеристик. Методы «динамического молекулярного портрета» в значительной степени дополняют современные технологии докинга, наглядно иллюстрируют комплементарность свойств поверхностей лиганда и белка-рецептора, позволяют характеризовать мозаичность поверхности клеточных мембран и т.д. Использование подобных технологий совместно с экспериментальными и независимыми вычислительными методами создает надежную основу для рационального конструирования новых биологически активных соединений с заданными свойствами.
Права человека и биоэтика
0.6222025 · CHAPTER · ru
Маличенко В. С.
Основополагающее влияние на формирование биоэтики как нового научного направления оказали стремительные темпы технологического развития, определившие необходимость систематизации принципов и правил научных исследований, а также практического применения полученных научных результатов. Биотехнологии, используемые в системе оказания медико-социальной помощи, обладают неоспоримым потенциалом в борьбе с наиболее масштабными угрозами безопасности человека, одновременно формируя ряд дилемм этического характера, которые могут привести к ужасающим последствиям для будущих поколений. Внедрение в практику новых технологий сопряжено с необходимостью решения задач правового и этического характера, а также обеспечения должного уровня контроля безопасности человека, что определяет целесообразность разработки соответствующего Федерального закона.
Ткани и органы человека как объекты гражданских прав
0.6102020 · BOOK · ru · Инфотропик Медиа
Масштабные научные открытия в области биомедицины и генетики XX–XXI вв. ознаменовали переход к принципиально новым подходам в сфере здравоохранения и изучении человека, предопределив качественное переосмысление значения био- материалов человека для науки и медицины, а также возникновение нового объекта права. Уровень развития современной науки и технологий открывает широкие возможности использования тканей и органов человека в медицинских, научных, производственных и иных целях при отсутствии достаточной правовой регламен- тации их принадлежности и оборота. Настоящее издание представляет собой комплексное исследование правовой природы отделённых тканей, органов и иных биоматериалов человека с учётом их двойственной природы — как объектов материального мира и как носителей генети- ческой (геномной) и иной информации. Детально охарактеризованы субъективные права на ткани и органы человека, определена правовая природа информированного добровольного согласия, зачастую выступающего единственным основанием ис- пользования биоматериалов и содержащейся в них информации. На основе анализа доминирующих правовых подходов к данной проблематике в странах романо-гер- манской и англо-американской правовых систем предложена авторская концепция правового регулирования тканей и органов человека как объектов гражданских прав. Книга рассчитана на студентов, аспирантов, научных сотрудников и практи- кующих юристов, а также предназначена для всех интересующихся проблемами науки, развития современного гражданского права и биотехнологий. Она может быть использована в научной и законопроектной работе, а также в преподавании гражданского права и специальных курсов по биомедицине.
Большие данные в биоинформатике
0.6102017 · ARTICLE · ru
Нафиса Наиловна Н., Исаев Е. А., Корнилов В. В., Первухин Д. В., Михаил Николаевич У. + ещё 2
Секвенирование человеческого генома началось в 1994 году. Понадобилось 10 лет работы многих научных коллективов для того, чтобы получить черновую последовательность ДНК человека. Современные технологии секвенирования позволяют получать геном конкретного человека за несколько дней. Обсуждаются успехи современной биоинформатики, связанные с появлением высокопроизводительных платформ секвенирования, которые не только способствовали расширению возможностей различных направлений биологии и других смежных наук, но и породили феномен больших данных. Обосновывается необходимость разработки новых технологий и методов для организации хранения, управления, анализа и визуализации больших данных. Современная биоинформатика столкнулась не только с проблемой больших данных, но и с огромным разнообразием методов обработки и представления, одновременным существованием различных программных средств и форматов данных. Обсуждаются пути решения возникших проблем, в частности путем использования наработок работы с большими данными из других областей современной жизни, таких как сетевой анализ и анализ деловых данных. Новые системы управления базами данных, отличные от реляционных, помогут решить проблему хранения больших данных и обеспечения приемлемого времени выполнения поисковых запросов. Новые технологии программирования, такие, как обобщенное программирование и визуальное программирование призваны решить проблему разнообразия форматов геномных данных и обеспечить возможность оперативного создания собственных скриптов для обработки данных.
Информационные технологии для доказательной медицинской практики
0.6072005 · BOOK · ru · Баку Юлдус
Начальные методы клеточной биологии
0.6072026 · BOOK · ru · Издательский дом НИУ ВШЭ
Антипова Н. В., Черткова Р. В., Князев Е. Н., Скворцов Д. А.
Учебно-методическое пособие по проведению практических занятий в рамках дисциплины "Клеточная биология: основы биопроцессов" знакомит с основными понятиями и определениями, необходимыми для работы с клеточными культурами. Практическая часть посвящена проведению лабораторных работ и содержит информацию о материалах, оборудовании и методах работы с клеточными культурами, в том числе в стерильных условиях. Издание предназначено для студентов и преподавателей факультета биологии и биотехнологии НИУ ВШЭ, а также профильных факультетов других вузов.Об авторах О книге на iq-media.ru
Информационные технологии в биомеханике зубопротезирования
0.6052014 · ARTICLE · ru
Логашина И. В., Татьяна Алексеевна Ч.
Обсуждаются некоторые аспекты применения компьютерных технологий на производстве, в медицине и в образовательном процессе. Обсуждаются требования к коллективам, способным решать многоуровневые задачи, связанные с эффективным использованием информационных технологий в биомеханике протезирования. Приводятся примеры получения такими коллективами комплексных результатов в науке, при практическом применении и в образовании.
Биопсихосоциальный подход к пониманию здоровья и болезни
0.6022015 · ARTICLE · ru
Рассказова Е. И., Александр Шамилевич Т.
С развитием психологии здоровья и биопсихосоциального подхода к здоровью и болезни в медицине и здравоохранении проблема психического здоровья приобретает статус междисциплинарной. Целью данной работы является рассмотрение возможностей и ограничений в применении биопсихосоциального подхода в психологии здоровья, в частности, к проблеме психического здоровья. Была выявлена неоднородность биопсихосоциального подхода, которая обусловлена выполнением трех различных функций в регуляции научных исследований: этического и социального ориентиров, методологического принципа, объяснительной модели. Понятие психического здоровья характеризуется спецификой, требующей уточнения в рамках биопсихосоциального подхода, в первую очередь - обсуждения иерархической и динамической организации биологических, психологических и социальных групп факторов.
Биомедицинские кластеры в мире: факторы успеха и истории лучших
0.5992019 · BOOK · ru · НИУ ВШЭ
Исланкина Е. А., Куценко Е. С., Фаина Николаевна Ф., Виктория Игоревна П., Попова Е. В. + ещё 1
Доклад, подготовленный Национальным исследовательским университетом «Высшая школа экономики» совместно с Фондом Международного медицинского кластера, представляет результаты исследования биомедицинских кластеров за рубежом. Его цель — выявить и обобщить лучшие практики развития и факторы успеха кластеров, в которых кооперация университетов, производственных компаний и клиник в сочетании с развитой инфраструктурой и инструментами государственной поддержки привели к значительному повышению качества врачебной помощи. В издании систематизированы положительные эффекты развития биомедицинских кластеров, представлено описание их глобального ландшафта, раскрыты ключевые факторы успеха, которые затем сопоставлены с основными аспектами деятельности Международного медицинского кластера. Авторы выражают уверенность, что публикация окажется полезной для специалистов, вовлеченных в процессы управления биомедицинскими кластерами, а также для всех, кто интересуется вопросами реализации кластерной политики и развитием здравоохранения.
Биология. Основы анатомии и физиологии человека
0.5952021 · BOOK · ru · Илекса
Гайдуков А. Е., Дубынин В. А., Сергей Валентинович М., Игорь Юрьевич С.
Предлагаемое пособие — краткое, но емкое изложение основных сведений по анатомии и физиологии человека, которые являются важнейшей частью школьного курса биологии. Издание предназначено для учащихся старших классов, а также всех тех, кто решил сдать ЕГЭ по биологии либо другие формы вступительных испытаний, связанные с поступлением в медицинские, биологические, психологические и некоторые другие вузы. Пособие написано коллективом авторов — преподавателей МГУ имени М.В. Ломоносова, обладающих многолетним опытом преподавания соответствующих разделов биологии школьникам на самых разных уровнях: от обычных средних школ до сборных заключительного этапа Всероссийских олимпиад. Авторы последовательно характеризуют все системы организма человека: опорно-двигательную, иммунную, сердечно-сосудистую, дыхательную, пищеварительную, выделительную и т.д. Особое внимание уделяется сложным вопросам школьной биологии, связанным с регуляцией деятельности перечисленных систем за счет управляющих сигналов мозга и работы эндокринных желез. Темы строения и функций нервной системы, а также физиологических основ психических процессов раскрываются в заключительной части пособия. Большинство глав сопровождается оригинальными авторскими иллюстрациями.
Социогуманитарные контуры геномной медицины
0.5942021 · BOOK · ru · ИНИОН РАН
Елена Евгеньевна Б., Елена Владимировна Б., Елена Валерьевна В., Мария Владимировна В., Елена Георгиевна Г. + ещё 11
В монографии рассматриваются этико-правовые и социально-психологические проблемы развития геномной медицины. Особое внимание уделяется биоэтическим вопросам развития биобанкинга, генетического тестирования, медико-генетического консультирования, а также проблемам социогуманитарного сопровождения развития генетических технологий в нашей стране. Для всех, кто заинтересован в понимании этических, правовых и социальных контекстов развития геномной медицины.
ПРОЕКТ BIOCAD «ЖИВИ БЕЗ СТРАХА» В ПОИСКАХ НОВОЙ МОДЕЛИ РАЗВИТИЯ
0.5932023 · CHAPTER · ru
Веселова А. С., Смельцова С. В., Екатерина Максимовна С.
Просветительский проект «Живи без страха» российской инновационной биотехнологической компании BIOCAD нацелен на профилактику и раннюю диагностику онкозаболеваний. На протяжении 5 лет проект показывал устойчивый рост, но к концу 2022 года возникла необходимость вдохнуть в него новую жизнь, чтобы привлечь внимание СМИ и общественности. Михаилу Егорову, главному герою кейса, руководителю отдела устойчивого развития BIOCAD, на основе отчета по реализации проекта придется принять сложное решение: сделать «Живи без страха» зонтичным брендом, расширить до полноценного портала об онкологии или оставить все как есть. Для ППС ВШЭ: Ознакомиться с демонстрационным файлом учебного кейса вы можете в Коллекции учебных кейсов ВШБ НИУ ВШЭ. Для получения полного комплекта материалов (текста учебного кейса и методических указаний для преподавателей) заполните форму обратной связи в карточке кейса. Для внешних преподавателей: По вопросам использования данного учебного кейса в образовательном процессе и получения доступа к методическим указаниям для преподавателей просьба обращаться по адресу электронной почты или через форму обратной связи на странице Ресурсного центра учебных кейсов ВШБ НИУ ВШЭ.
NEREL-BIO: A Dataset of Biomedical Abstracts Annotated with Nested Named Entities
0.5892023 · ARTICLE · en
Natalia L., Suresh M., Elina B., Igor R., Браславский П. И. + ещё 3
Motivation This paper describes NEREL-BIO – an annotation scheme and corpus of PubMed abstracts in Russian and smaller number of abstracts in English. NEREL-BIO extends the general domain dataset NEREL (Loukachevitch et al., 2021) by introducing domain-specific entity types. NEREL-BIO annotation scheme covers both general and biomedical domains making it suitable for domain transfer experiments. NEREL-BIO provides annotation for nested named entities as an extension of the scheme employed for NEREL. Nested named entities may cross entity boundaries to connect to shorter entities nested within longer entities, making them harder to detect. Results NEREL-BIO contains annotations for 700+ Russian and 100+ English abstracts. All English PubMed annotations have corresponding Russian counterparts. Thus, NEREL-BIO comprises the following specific features: annotation of nested named entities, it can be used as a benchmark for cross-domain (NEREL → NEREL-BIO) and cross-language (English → Russian) transfer. We experiment with both transformer-based sequence models and machine reading comprehension (MRC) models and report their results. Availability The dataset and annotation guidelines are freely available at https://github.com/nerel-ds/NEREL-BIO.
КЛАССИФИКАЦИЯ ВНЕКОРНЕВЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ ЯБЛОНЕВЫХ КУЛЬТУР МЕТОДАМИ КОМПЬЮТЕРНОГО ЗРЕНИЯ
0.5882021 · ARTICLE · ru
Sergei N. T., Перов А. А., Alexander L. O.
Цель. Разработка модели сверточной нейронной сети для определения вне - корневых заболеваний яблонь по фотографиям листьев с мобильного телефона. Методы и материалы исследования. Материалом для исследований по - служили размеченные изображения с различными видами внекорневых заболе - ваний яблони, опубликованные в открытом доступе платформы Kaggle. Ме - тоды исследования: теория проектирования и разработки информационных систем, программирования, методы аугментации и расширения датасетов для задач компьютерного зрения, методы настройки гиперпараметров обу - чения моделей нейронной сети. Результаты. Яблоня (Malus) – многолетняя древесная культура рода Malus. Яблоки – основная плодовая культура России. Яблоня как плодовая культура распространена почти во всех странах умеренного климата, а в России она выращивается повсеместно – от северных регионов до юга [3]. Заболевания яблонь является одной из главных причин снижения урожай - ности садов по всему миру. Для профилактики и раннего предупреждения распространения заболеваний яблонь необходим инструмент в виде модели нейронной сети, позволяющей определить наличия заболевания по фотогра - фии со смартфона листьев яблони. В работе использовались методы глубин - ного обучения сверточных нейронных сетей, а также концепция «transfer learning». На базе сети EfficientNet была обучена нейронная сеть, позволяю - щая с точностью 0,9842 по метрике F1-score определять наличие некорневых заболеваний яблони по изображению листьев. Заключение. Был подготовлен набор данных изображений листьев яблонь, включающий четыре класса, для эффективной классификации ней - ронной сетью. Два класса с признаками определенного заболевания яблони, один класс для наличия более одного заболевания и один класс для здоровых яблонь. Построена и обучена модель для решения задачи классификации по обнаружению болезни яблонь по изображениям листьев со смартфона.
The Social Legitimation of Biomedical Technologies in Russia: Communication Challenges for Science and Society
0.5852013 · PREPRINT · en
Развитие института медицины на протяжении всей своей истории сопровождалось расширением границ медицинской экспертизы. С развитием новых медицинских технологий, в частности, техник манипуляции с биологическим материалом человека, встал вопрос об определении понятий, о границах между человеком и его биологическим материалом. В рамках данной статьи анализируется научный, политический и культурный дискурс вокруг данной тематики. Например, анализ публичного дискурса о стволово-клеточных технологиях показывает, как расширение границ медицинской экспертизы становится импульсом к оспариванию ее статуса в рамках этической экспертизы. При этом данный конфликт не препятствует процессу социальной легитимации стволово-клеточных технологий.
Исследование особенностей обучения саморегуляции с использованием разных видов биологической обратной связи
0.5842012 · CHAPTER · ru
Н.В. Р., Рамендик Д. М., Мельникова М. С.
Тезисы освещают исследование особенностей обучения саморегуляции с использованием разных видов биологической обратной связи. Биологическая обратная связь (БОС) – это один из методов обучения людей саморегуляции, который в последние годы приобрел большую популярность. Современная аппаратура открывает возможность для реализации нескольких протоколов биоуправления. ЭЭГ-тренинги позволяют выработать навык удержания в ЭЭГ того или иного заданного ритма (альфа или бета, тета или их определенного соотношения). Биоуправление вегетативными функциями (сердечным ритмом, температурой) осуществляется проще и используется в подготовке к экстремальным видам деятельности, в том числе в тренировке спортсменов В настоящее время нет ясного представления о том, в каких случаях какая форма БОС предпочтительнее. В данном сообщении приводятся результаты двух экспериментов по обучению саморегуляции с использованием разных БОС-технологий.
Мое тело — моя крепость: общественное мнение о биомедицинских технологиях
0.5842016 · ARTICLE · ru
Войнилов Ю. Л., Полякова В. В.
Статья рассматривает «поворот к телу» в социальных науках в контексте развития биомедицинских технологий. Социальные трансформации второй половины XX века, т. е. «биомедикализация общества», актуализировали изучение тела в рамках социологической традиции. Однако предпосылки актуализации остаются не проясненными. Поэтому первая задача работы — показать, каким образом тема биомедицинских технологий связана с современной социологией. Для этого рассматриваются знаковые открытия в области медицины, генетики, описывается их влияние на общественные институты. Вторая задача статьи связана с изучением социальных установок россиян в отношении биомедицинских технологий в повседневной жизни. Опрос россиян, проведенный ИСИЭЗ НИУ ВШЭ, позволил оценить меру готовности респондентов включить современные технологические инновации в повседневную жизнь. Показательно настороженное отношение к биомедицинским технологиями при том, что достижения в технологической и IT-сферах оцениваются положительно. Результаты исследования дают основания полагать, что инвазивные технологии имеют особый статус в общественном сознании. Сама возможность глубокой трансформации тела на данный момент отторгается большинством населения. Авторы полагают, что дальнейшее изучение описанной ситуации представляется перспективным для исследований в области биоэтики.
Картирование медицинской науки: результаты интеллектуального анализа больших данных
0.5832026 · ARTICLE · ru
Гребенюк А. Ю., Лобанова П. А., Саввин Н. В., Сабидаева Е. А.
Цель исследования. Анализ актуальной глобальной повестки в медицинской науке. Материал и методы. В статье предлагается подход к построению медицинского исследовательского ландшафта на основе семантического анализа и картирования медицинских тематик с помощью системы интеллектуального анализа больших данных iFORA. Для этого была проведена векторизация 2252 тематик из англоязычных статей, опубликованных в 2024 г., относящихся к сфере медицины, эмбеддинги были получены с помощью модели Jina (jina-embeddings-v3). Результаты. В рамках проведенного исследования была картирована научно-технологическая повестка мировой медицинской науки, которая охватывает 25 тематических кластеров. Были выделены самостоятельные кластеры, посвященные технологиям диагностики, лечения и профилактики заболеваний, кластеры, связанные с отдельными нозологиями, системами и комплексами в организме, платформенными направлениями в сфере наук о жизни, а также кластеры в области организации и политики здравоохранения, цифровизации, фармацевтики и смежных с медициной областей. В статье также приведены наиболее значимые тематики в каждом кластере с учетом их упоминаемости в научной литературе за 2024 г. Заключение. Понимание глобальной повестки в медицинской науке и наиболее актуальных технологических трендов является ключом к развитию инновационных технологий в этой сфере. Результаты исследования могут стать информационной основой для выбора приоритетов и фокусировки мер поддержки развития науки и технологий в области медицины.